专利许可的纳税方式如下：
特许权使用费所得：个人提供专利权、商标权、著作权、非专利技术以及其他特许权的使用权取得的所得，属于特许权使用费所得。根据《个人所得税法》及其实施条例，这部分所得需要缴纳个人所得税。
应纳税所得额计算：特许权使用费所得在扣除营业税（已不再征收）和相关费用后，按照20%的税率计算应纳税额。具体计算方式如下：
每次收入不超过4000元的，减除费用800元，其余额为应纳税所得额。
每次收入在4000元以上的，减除20%的费用，其余额为应纳税所得额。
应纳税额 = 应纳税所得额 × 20%。
专利证书及许可合同需要交印花税。根据印花税相关法规，转让专利合同适用“产权转移书据”税目，税率为0.5‰。
如果涉及专利的所有权转让，则按照“销售无形资产”税目缴纳增值税，税率为3%。同时，城市维护建设税、教育费附加和地方教育附加随同增值税一并征收。
转让专利收入还需要缴纳城建税和教育费附加。
建议
咨询专业税务人员：由于税法规定可能会有所变动，建议在具体操作前咨询专业的税务人员，以确保合规性和准确性。
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